X


[ Pobierz całość w formacie PDF ]

(2008) 435 447.
of type 2 with number density �2, when the inter-particle distance
[7] W.M. Brown, P. Wang, S.J. Plimpton, A.N. Tharrington, Comput. Phys. Commun.
changes from r0 to rt , as
182 (2011) 898 911.
M� M� ]� a�
[8] S. Pennycook, S. Jarvis, 3rd International Workshop on Performance Modeling,
rc "
rt - r0
2 Benchmarking and Simulation of High Performance Computer Systems,
�'"V �' = 4�r0 �2V (rt)G dr0 drt (3)
PMBS12.
�
0 r!
[9] S.J. Pennycook, C. Hughes, M. Smelyanskiy, S. Jarvis, IEEE International Parallel
M� M� '�
rc "
& Distributed Processing Symposium.
2 2
H" 4�r0 �2 V (rc)(rt - rc) (4)
[10] J. van Meel, A. Arnold, D. Frenkel, S. Portegies Zwart, R. Belleman, Mol. Simul.
-" r!
34 (2008) 259 266.
+� ]� a�
[11] M.S. Friedrichs, P. Eastman, V. Vaidyanathan, M. Houston, S. Legrand, A.L.
1 rt - r0
2 2
Beberg, D.L. Ensign, C.M. Bruns, V.S. Pande, J. Comput. Chem. 30 (2009)
+ V (rc) (rt - rc)2 G dr0 drt (5)
864 872.
2 �
[12] Z. Yao, J.-S. Wang, G.-R. Liu, M. Cheng, Comput. Phys. Commun. 161 (2004)
M� M� '�
rc "
27 35.
2
[13] S. Meloni, M. Rosati, L. Colombo, J. Chem. Phys. 126 (2007) 121102.
H" 4�(r! + � )2�2 V (rc)(rt - rc) (6)
[14] U. Essmann, L. Perera, M.L. Berkowitz, T. Darden, H. Lee, L.G. Pedersen, J. Chem.
-" r!
+� ]� a� Phys. 103 (1995) 8577 8592.
1 rt - r0
[15] J.E. Stone, J.C. Phillips, P.L. Freddolino, D.J. Hardy, L.G. Trabuco, K. Schulten, J.
2 2
+ V (rc) (rt - rc)2 G dr0 drt (7)
Comput. Chem. 28 (2007) 2618 2640.
2 �
[16] P. Eastman, V.S. Pande, J. Comput. Chem. 31 (2009) 1 5.
�
1 [17] S. Pronk, S. P�ll, R. Schulz, P. Larsson, P. Bjelkmar, R. Apostolov, M.R. Shirts, J.C.
2
= 4�(r! + � )2�2 V (rc)
Smith, P.M. Kasson, D. van der Spoel, B. Hess, E. Lindahl, Bioinformatics (2013).
2
[18] P. Gonnet, J. Comput. Chem. 28 (2007) 570 573.
$� Z� ^� Z� ^�(�
rb 2 2 rb [19] U. Welling, G. Germano, Comput. Phys. Commun. 182 (2011) 611 615.
� rb� G - (rb + � )E (8)
[20] NVIDIA, CUDA C Programming Guide, 2012.
� �
[21] H.J.C. Berendsen, J.R. Grigera, T.P. Straatsma, J. Phys. Chem. 91 (1987)
$� Z� ^�
1 rb
2 2 2 2 6269 6271.
+ V (rc) � (rb + � )G
[22] S. Miyamoto, P.A. Kollman, J. Comput. Chem. 13 (1992) 952 962.
6 �
[23] J.P. Ryckaert, G. Ciccotti, H.J.C. Berendsen, J. Comput. Phys. 23 (1977) 327 341.
Z� ^�(� �
rb
2 2 [24] R.A. Lippert, K.J. Bowers, R.O. Dror, M.P. Eastwood, B.A. Gregersen, J.L. Klepeis,
- rb(rb + 3� )E . (9)
I. Kolossvary, D.E. Shaw, J. Chem. Phys. 126 (2007) 046101.
� [ Pobierz całość w formacie PDF ]

  • zanotowane.pl
  • doc.pisz.pl
  • pdf.pisz.pl
  • granada.xlx.pl
  •  

    Drogi użytkowniku!

    W trosce o komfort korzystania z naszego serwisu chcemy dostarczać Ci coraz lepsze usługi. By móc to robić prosimy, abyś wyraził zgodę na dopasowanie treści marketingowych do Twoich zachowań w serwisie. Zgoda ta pozwoli nam częściowo finansować rozwój świadczonych usług.

    Pamiętaj, że dbamy o Twoją prywatność. Nie zwiększamy zakresu naszych uprawnień bez Twojej zgody. Zadbamy również o bezpieczeństwo Twoich danych. Wyrażoną zgodę możesz cofnąć w każdej chwili.

     Tak, zgadzam siÄ™ na nadanie mi "cookie" i korzystanie z danych przez Administratora Serwisu i jego partnerów w celu dopasowania treÅ›ci do moich potrzeb. PrzeczytaÅ‚em(am) PolitykÄ™ prywatnoÅ›ci. Rozumiem jÄ… i akceptujÄ™.

     Tak, zgadzam siÄ™ na przetwarzanie moich danych osobowych przez Administratora Serwisu i jego partnerów w celu personalizowania wyÅ›wietlanych mi reklam i dostosowania do mnie prezentowanych treÅ›ci marketingowych. PrzeczytaÅ‚em(am) PolitykÄ™ prywatnoÅ›ci. Rozumiem jÄ… i akceptujÄ™.

    Wyrażenie powyższych zgód jest dobrowolne i możesz je w dowolnym momencie wycofać poprzez opcję: "Twoje zgody", dostępnej w prawym, dolnym rogu strony lub poprzez usunięcie "cookies" w swojej przeglądarce dla powyżej strony, z tym, że wycofanie zgody nie będzie miało wpływu na zgodność z prawem przetwarzania na podstawie zgody, przed jej wycofaniem.